Afyonkarahisar, su kaynakları açısından zengin bir bölge olup, çeşitli kaynakların sağladığı su ile hem tarım hem de içme suyu ihtiyaçlarını karşılamaktadır. Bu kaynaklar, doğal güzellikleri ve sağlık turizmi potansiyeli ile de dikkat çekmektedir. Bölgedeki su kaynaklarının yönetimi, halkın su ihtiyacını karşılamak ve çevresel dengeyi sağlamak açısından büyük önem taşımaktadır.

Afyonkarahisar'ın su kaynakları şunlardır:

• Termal kaynaklar. Afyonkarahisar, Gazlıgöl, Ömer-Gecek, Heybeli ve Sandıklı gibi bölgelerde yoğunlaşan yüksek mineralli jeotermal kaynaklara sahiptir. Bu kaynaklar, hem sağlık turizmi hem de enerji ve ısınma alanında değerlendirilmektedir.
• Akdeğirmen Barajı. Afyonkarahisar şehir şebekesine sağlanan içme suyu, büyük ölçüde Akdeğirmen Barajı'ndan karşılanmaktadır.
• Eber Gölü. Afyonkarahisar'ın su kaynaklarından biridir.

Ayrıca, Afyonkarahisar'ın içme suyu, Akarçay Nehri üzerine inşa edilen Akdeğirmen Barajı'ndan alınarak arıtma tesisinde işlenmektedir.