Bayraklı Sultan Türbesi, Kastamonu'nun tarihi dokusunda derin izler bırakan bir kahramanlık hikayesinin merkezinde yer alır. Bu türbe, bir yiğidin cesareti ve fedakarlığı sayesinde tarihe damgasını vurmuş bir sembol haline gelmiştir. Selçuklu döneminde yaşanan bir kuşatma esnasında, cesur bir savaşçı olan Yunus Mürebbi'nin gösterdiği azimle bayrağı dalgalandırması, halk arasında ona "Bayraklı Sultan" unvanını kazandırmıştır. İşte bu hikaye, sadece bir savaşın ötesinde, bir milletin bağımsızlık ve özgürlük arzusunun güçlü bir simgesidir.

Bayraklı Sultan Türbesi'nin hikayesi, Kastamonu Kalesi'nin Selçuklular tarafından kuşatılması sırasında yaşanan bir olaya dayanır. Kuşatma uzayınca yiğitlerin sabrı tükenir ve bir gün toplantı yapılır. Karara göre, ertesi gün güneş doğmadan kaleye saldırı düzenlenecek ve bayrağı ilk diken yiğide armağan edilecektir. Ertesi sabah yapılan saldırıda, ünlü yiğit Yunus Mürebbi, elindeki ipi burcun sivri dişlerine takarak hızla kaleye tırmanır. Koynundan çıkardığı kılıcıyla yiğitçe dövüşür ve sancağı kaleye diker. Savaşın ardından sancak kalede dalgalanırken, Yunus Mürebbi görünmez. Adamları onu bulduğunda, kanlar içinde yatmakta ve sancağı hala sımsıkı tutmaktadır. Bu yüzden "Bayraklı Sultan" olarak anılmaya başlanır. Halk, dileği gerçekleşsin diye Bayraklı Sultan'a bayrak adar.