Ergene Ovası, coğrafi yapısıyla dikkat çeken bir bölge olup, deniz seviyesinden 25 metre kadar yükseklikte yer alır. Bu özellik, ova çevresindeki doğal formasyonları ve ekosistemi etkileyen önemli bir faktördür. Ayrıca, ovanın güney kısmında yer alan hafif engebeli plato, bölgenin topografyasında farklılıklar yaratmaktadır.

Ergene Ovası'nın yüksekliği, denizden yaklaşık 25 m civarındadır. Ayrıca, ovanın bulunduğu havzanın güney bölümü, yükseltisi 150-200 m arasında olan hafif dalgalı bir plato halindedir.